В 1983 г. окончила с отличием педиатрический факультет 2-го МОЛГМИ им.Н. И.Пирогова. В 1983-1985 гг. обучалась в клинической ординатуре, в 1985-1988 гг. – в аспирантуре на кафедре нервных болезней пед.фак. 2-го МОЛГМИ им.Н.И.Пирогова. В 1988 г. защитила кандидатскую диссертация на тему «Изменения кальций-регуляторной гормональной системы при прогрессирующих мышечных дистрофиях». С 1988 по 1993 г. работала ассистентом, а затем - доцентом кафедры нервных болезней педиатрического факультета. Российского медицинского университета.
     С 1994 по 1999 г. работала в должностях старшего научного сотрудника, затем – ведущего научного сотрудника отдела психоневрологии и эпилептологии МНИИ педиатрии и детской хирургии. В 1999 г. защитила докторскую диссертацию на тему «Закономерности формирования и динамика течения парциальных эпилепсий у детей. Дифференцированная медикаментозная терапия и профилактика инвалидизации". С 1999 по 2002 г. являлась руководителем отдела психоневрологии и эпилептологии МНИИ педиатрии и детской хирургии.
    В 1993-1994 гг. проходила стажировку в эпилептическом центре Бетель, г. Билефельд, Германия, в 1995-1996 гг. стажировалась в эпилептическом центре Хефата, г. Швальмштадт-Трайза, Гемания.
    С 2002 г. по настоящее время работает руководителем детского отделения  Датского эпилептического центра, г. Дианалунд, Дания. С 2010 г. является профессором Южно-датского университета, г. Оденсе.
     М.Ю. Никанорова – автор более 100 публикаций на русском, английском и датском языках, редактор, автор и соавтор 6 книг (3 – на русском и 3 – на английском языках). Научные интересы – генетика эпилепсий, эпилептические энцефалопатии у детей, лекарственная резистентность.